Итак, мы начинаем конструирование наносистемы с ряда молекулярных машин (Molecular Device). Их можно либо импортировать в программу в уже нам знакомом *.pdb формате, либо собрать в программе самому, либо написать на языке nanoML. Например, нам необходимо построить систему из нанотрубки, внутри которой будет находиться фуллерен (такая структура может использоваться в наногидравлике). Для этого мы перетаскиваем мышкой объект Nanotube в менеджер иерархии Nanodevice Component (см. рис. 5), определяя далее ее характеристики — длину, диаметр, состав (см. рис. 6). Заметим, что использование программы Chem3D для подобной задачи было бы неудобно.
Открываем далее вертикальную закладку справа Display, и можем видеть схематическое изображение нанотрубки (см. рис. 7). Видим под моделью ползунок масштабирования — с помощью которого можно изменить масштаб модели на сколько угодно. Также отображаются реальные размеры объекта, что важно для инженерного проектирования.
Далее выбираем из линейки инструментов фуллерен и тянем его в менеджер иерархии Nanodevice Component таким же образом, как мы создавали нанотрубку. Из меню выберем фуллерен С26. С помощью закладки Structure разместите фуллерен внутри нанотрубки, предварительно повернув ее (см. рис. 8). Затем измените параметры нанотрубки, выбрав в верхней закладке (5, 5) Carbon Nanotube (нанотрубка возьмется в синюю сетку), и нажав на кнопке Edit сверху окна изображения. Поставьте ползунком Arm Chair радиус не менее 0,7 нм, а ползунком Lenght длину не менее 3 нм. В нанотрубку такой конфигурации без труда войдет фуллеррен, и будет свободно по ней перемещаться (рис. 9). То, что на рисунке фуллерен значительно меньше нанотрубки объясняется каркасной визуализацией. Используя визуализацию поверхностей минимальной энергии мы увидим, что фуллерен «плотно» входит в нанотрубку.
Для просмотра модели используйте кнопки осей координат, нарисованные сверху. Вот мы и создали простейшее наноустройство.
Отсюда
Это какой-то нереальный, фантастический пиздец…